Το τμήμα προστασίας αποτελεί κομβικό τομέα της λειτουργίας της INTERSOS Hellas. Η δράση του τομέα προστασίας υιοθετεί μια προσέγγιση η οποία έχει στον πυρήνα της την ενδυνάμωση της κοινότητας.

Ενδεικτικά, περιλαμβάνει υπηρεσίες διαχείρισης υποθέσεων (Case Management), παροχή υποστηρικτικών υπηρεσιών, ψυχοκοινωνική υποστήριξη, νομική συνδρομή, παραπομπές σε εξειδικευμένες υπηρεσίες και συνοδεία σε δημόσιες υπηρεσίες και υπηρεσίες υγείας.